一、基本概況：

陳紅菊，女，中國科學院大學博士。主持雲南省自然科學基金項目1項；雲南省教育廳項目2項；中國科學院遺傳資源與進化國家重點實驗室項目2項；公開發表論文10餘篇。

研究方向：（1）腸道菌群與疾病狀态評估模型的建立與統計學分析

         （2）人類微生物菌群醫學生态學理論和方法研究

二、科研論文發表情況

[1] Chen HJ, Yi B, Ma ZS. (2025). Resilience of human gut microbiomes in autism spectrum disorder: measured using stiffness network analysis. Microbiology Spectrum, 13: e01078-24.

[2] Chen HJ, Li Lianwei, Yu Fubing, Ma ZS. (2024). A comprehensive diversity analysis on the gut microbiomes of ASD patients: form alpha, beta to gamma diversities. Fems Microbiology Letters, fnae014

[3] Ma ZS, Li Lianwei, Chen HJ. (2024). Unique and enriched microbes and their potential “allies and foes” in the human gut microbiomes of ASD patients. Research in Autism Spectrum Disorders, 117, 102440

[4] Chen HJ, Ma ZS. (2022). Further Quantifying the Niche-Neutral Continuum of Human Digestive Tract Microbiomes with Near Neutral Model and Stochasticity Analysis. Evolutionary Bioinformatics online, 18, 11769343221128540.

[5] Chen HJ, Yi B, Qiao Y et al. (2022). Diversity-scaling analysis of human breast milk microbiomes from population perspective. Frontiers in Microbiology, 13, 940412.

[6] Chen HJ, Ma ZS. (2022). Niche-Neutral Continuum Seems to Explain the Global Niche Differentiation and Local Drift of the Human Digestive Tract Microbiome. Frontiers in Microbiology, 13, 912240.

[7] Yi B, Chen HJ. (2022). Power law analysis of the human milk microbiome. Archives of Microbiology, 204(9), 585.

[8] Zhou J, Yuan Y, Xu P, Yi B, Chen HJ*, Su, W. (2022). Host-Population Microbial Diversity Scaling of Chinese Gut Microbiomes in Gout Patients. Evolutionary Bioinformatics online, 18, 11769343221095858.

[9] Chen HJ, Yi B, Liu Q, Xu X., Dai, L., Ma ZS. (2021). Diversity Scaling of Human Digestive Tract (DT) Microbiomes: The Intra-DT and Inter-individual Patterns. Frontiers in Genetics, 12, 724661.

[10] Chen HJ, Peng S, Dai L, Zou Q, Yi B, Yang X, Ma, ZS. (2017). Oral microbial community assembly under the influence of periodontitis. PloS One, 12(8), e0182259.

三、主持和參與科研項目

[1]雲南省教育廳項目，2023J1110, Covid-19患者的腸道微生物DAR模型研究, 2022.12-2023.12, 2萬元，已結題，主持

[2]雲南省科技廳青年項目，202001BA070001-100, 網絡分析和博弈理論在宏基因組生物信息學研究中的應用, 2019.6-2022.6, 5萬元，已結題，主持

[3]雲南省教育廳項目，2019J0646, 基于DAR模型研究彌勒溫泉微生物群落的生物多樣性, 2019.12-2020.12, 2萬元，已結題，主持

[4]中國科學院遺傳資源與進化國家重點實驗室開放課題，GREKF19-07, 腸道菌群多樣性與疾病關系的生态機制研究, 2019.6-2022.5, 9萬元，已結題，主持

[5]中國科學院遺傳資源與進化國家重點實驗室開放課題，GREKF13-03, 微生物群落的生态位-中性混合效應研究, 2013.6-2015.5, 13萬元，已結題，主持

[6]國家自然科學基金面上項目, 31970116，菌群多樣性與疾病關系的生态機制及病因研究, 2020.01-2023.12, 32萬元，已結題，參與

[7]雲南省科技廳青年項目, 202101BA070001-018, 微生物菌群的複雜網絡可控性研究 2021.1-2024.11, 5 萬元，已結題, 參與

[8]雲南省教育廳項目, XJ4Y06, 關于“ICM+3IM”猜想的研究, 2017.1-2019.1, 2萬元，已結題，參與

[9]雲南省重大科技專項計劃項目, 202402AA310017, 多階段篩選胃内益生菌治療幽門螺杆菌及其抗藥性應對策略技術研發, 2024.1-2026.12, 600萬元，在研，參與

四、獲得主要學科競賽獎勵與榮譽

[1] 2017年榮獲第三屆全國高校數學微課程教學設計競賽西南賽區一等獎

[2] 指導全國大學生數學建模競賽榮獲雲南省三等獎，2020年，中國工業與應用數學學會

[3] 指導第十二屆全國大學生市場調查與分析大賽雲南省二等獎，2021年，教育部高校統計教指委

[4] 指導國家級大創項目，第三代基因測序組裝策略優化及在生物醫藥的應用，2021年創業實踐項目，結題為優秀

五、主持教學改革與質量工程項目

[1]本科教學建設與教學改革項目，《高等數學》教學改革探析，JJJG171021，2020年，校級.

六、教改論文發表情況

[1]陳紅菊,易斌. 一類帶有取整符号的級數的收斂性[J].高等數學研究,2025.